    Para poder comenzar el ajuste Aerotri necesita unos valores aproximados de las coordenadas de los centros de proyección y de los puntos medidos (puntos de apoyo y puntos de aerotriangulación). Estos valores se toman del fichero de GPS/INS para los centros de proyección, si existe ese fichero, y en caso contrario los calcula el programa.

    El ajuste del bloque en sí emplea como datos de entrada los ficheros de "fotogramas", "apoyo", "valores aproximados" y "GPS e INS". Se pueden emplear puntos de apoyo completos, planimétricos o altimétricos, así como puntos de control. Además de estos ficheros es necesario indicar los parámetros de la proyección cartográfica y los valores de precisión de las medidas, esto es, de la fotocoordenadas, coordenadas de los puntos de apoyo, coordenadas GPS y giros INS de los centros de proyección.
    El ajuste de la aerotriangulación se lleva a cabo mediante el método de haces, que establece directamente relaciones entre las fotocoordenadas y el terreno mediante la ecuación de colinealidad, sin pasar por modelos intermedios. Se realiza por tanto un ajuste simultáneo de todas las observaciones, incluyendo como tales, además de las fotocoordenadas, las coordenadas de los puntos de apoyo (salvo que se obligue a que sean fijos) y las coordenadas GPS e INS de los centros de proyección. Al tratar todos los datos en conjunto y no realizar ningún paso intermedio se aprovecha al máximo toda la información.
    El ajuste prevé que los datos GPS e inerciales puedan incluir un error constante, distinto para cada pasada. Este posible error sistetmático se calcula y se corrige, por lo que no influye en el cálculo y las observaciones GPS se pueden emplear con su precisión relativa de un centro respecto a otro, que es mucho mayor que la precisión absoluta, debido a dicho error constante.

    La configuración por defecto emplea un estimador robusto, lo que permite la detección y eliminación de manera automática de observaciones erróneas, como un punto medido en un cierto punto en una pasada pero en un punto distinto en la pasada siguiente, un punto de apoyo con la Z errónea por confusión de tipo arriba/abajo, observaciones GPS o INS de los centros de proyección erróneas, etc. La función de pesos del estimador robusto se diseño específicamente para aerotriangulaciones. Su gráfica se muestra hacia el final del manual de Aerotri.
    También por defecto se calculan parámetros de autocalibración, lo que puede mejorar mucho la precisión en bloques grandes. El programa calcula unos parámetros por defecto de entre un conjunto más amplio, por lo que si fuese necesario se pueden seleccionar más parámetros para el cálculo y, al contrario, si se considera oportuno se pueden eliminar algunos o todos los parámetros del cálculo. La longitud focal y el punto principal no se incluyen etre los parámetros por defecto porque no se debe intentar calcularlos nunca en un vuelo salvo configuraciones muy específicas.
